Свой дебютный матч в клубных турнирах Азии  «Истиклол» сыграл 13 мая 2011 года против команды «Джабаль Аль-Мукабер» (2:0) из Палестины в розыгрыше Кубка Президента АФК.

С тех пор  столичные футболисты успели на сегодняшний день сыграть 80  матчей во всех четырех  клубных турнирах АФК:

Лига чемпионов АФК – 22 матча, Кубок АФК – 42 матча, Кубок Президента АФК – 10 матчей. Лига чемпионов-2 АФК – 6 игр.